SpatialCell

项目简介

SpatialCell 是一个用于分析空间细胞数据的工具包。该工具包提供了一系列函数，用于处理和分析细胞形态学特征、细胞间互作网络、细胞邻域成分等。

功能

• 1: 使用GaussianMixture对细胞进行注释
• 2: 计算细胞分布形成的形态学特征，包括纤维度、卷曲度和伸长率。
• 3: 指定细胞的细胞邻域成分分析
• 4: 计算并可视化细胞类型之间的距离，基于几何空间定位细胞与细胞之间的相互作用网络，搜索特定细胞的空间分布模式 ，

安装

请确保已安装以下依赖项：

• numpy
• pandas
• scikit-learn
• alphashape
• scipy

你可以使用以下命令安装这些依赖项：

pip install numpy pandas scikit-learn alphashape scipy